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Vier Fälle der Omikron-Variante des SARS-CoV-2 in Bayern per Genomsequenzierung bestätigt
Am 27.11.2021 wurde bei vier Reiserückkehrern aus dem südlichen Afrika eine Infektion mit SARS-CoV-2 nachgewiesen. Am Max von Pettenkofer-Institut der LMU München wurden daraufhin mehrere varianten-spezifische PCRs durchgeführt und die Variant-of-concern Omikron (B.1.1.529) zweifelsfrei nachgewiesen. Der Befund konnte bereits am Folgetag durch eine Vollgenomsequenzierung bestätigt werden. Dazu wurde im Rahmen des Bay-VOC-Netzwerks am Genzentrum der LMU München eine Nanopore-Sequenzierung durchgeführt. Innerhalb von Stunden konnten dadurch die Sequenzen der Genome bestimmt und die charakteristischen Mutationen nachgewiesen werden.
Ausschnitt einer Region im Spike Protein. Mutationen in den sequenzierten Genomabschnitten sind farblich hervorgehoben.